Doğu Akdeniz Araştırma ve Uygulama Merkezi (Doğakmer), bilimin farklı disiplinlerinde derinlemesine araştırmalar yapma kapasitesine sahip, nitelikli araştırmacıların yetişmesine öncülük etmeyi misyon edinmiştir. Bu bağlamda, merkez; kamu ve özel sektör kuruluşları ile ulusal ve uluslararası bilim çevrelerinin ihtiyaç duyduğu nitelikli elemanların yetiştirilmesi için gerekli eğitim, öğrenim ve araştırma ortamını sağlamaktadır.
Doğakmer, bilimsel mükemmeliyetin sürdürülmesi ve bilim insanlarının kariyerlerini ilerletebilmeleri için gerekli olanakları sunmayı hedeflemektedir. Bu doğrultuda, genç araştırmacılara, bilimin çeşitli alanlarında araştırma yapabilme fırsatı tanımaktadır. Aynı zamanda, merkez; multidisipliner bir yaklaşımla, bilimsel araştırmaların yanı sıra, sektörel ihtiyaçlara yönelik uygulamalı projelerin geliştirilmesine de katkıda bulunmaktadır.
Bu misyon, Doğakmer'in bilimsel araştırmaların yanı sıra, sektörel ve toplumsal ihtiyaçlara cevap verebilen, ulusal ve uluslararası düzeyde tanınan bir merkez olma vizyonuyla paraleldir.